Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Tnnt3Q9QZ47 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Tnnt3Q9QZ47 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.1 ms