Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Irx4Q9QY61 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Irx4Q9QY61 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.2 ms