Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rnft1Q9DCN7 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.9 ms