Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc47Q9D024 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc47Q9D024 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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