Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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