Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Tdrd12Q9CWU0 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Tdrd12Q9CWU0 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tdrd12Q9CWU0 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.6 ms