Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c1Q8K193 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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Cldn34c1Q8K193 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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Cldn34c1Q8K193 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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Cldn34c1Q8K193 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn34c1Q8K193 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.2 ms