Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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