Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Actn1Q7TPR4 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Actn1Q7TPR4 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Actn1Q7TPR4 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Actn1Q7TPR4 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Actn1Q7TPR4 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Actn1Q7TPR4 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Actn1Q7TPR4 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Actn1Q7TPR4 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Actn1Q7TPR4 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 339.2 ms