Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Irx1P81068 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Irx1P81068 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Irx1P81068 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Irx1P81068 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Irx1P81068 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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