Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Hoxd11P23813 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms