Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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