Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Casq1O09165 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Casq1O09165 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Casq1O09165 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Casq1O09165 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
Casq1O09165 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Casq1O09165 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Casq1O09165 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Casq1O09165 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Casq1O09165 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Casq1O09165 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Casq1O09165 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Casq1O09165 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Casq1O09165 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Casq1O09165 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Casq1O09165 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Casq1O09165 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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