Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.8 ms