Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cldn12Q9ET43 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cldn12Q9ET43 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms