Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc47Q9D024 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc47Q9D024 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.4 ms