Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RpainQ9CWY9 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms