Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ykt6Q9CQW1 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ykt6Q9CQW1 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
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Ykt6Q9CQW1 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ykt6Q9CQW1 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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