Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Apobec3Q99J72 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Apobec3Q99J72 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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