Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NinlQ6ZQ12 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm22013-201ENSMUST00000158788 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NinlQ6ZQ12 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.5 ms