Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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Ttf1Q62187 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
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Ttf1Q62187 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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Ttf1Q62187 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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Ttf1Q62187 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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Ttf1Q62187 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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Ttf1Q62187 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ttf1Q62187 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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Ttf1Q62187 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ttf1Q62187 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ttf1Q62187 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ttf1Q62187 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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Ttf1Q62187 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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Ttf1Q62187 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
Ttf1Q62187 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
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Ttf1Q62187 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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Ttf1Q62187 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ttf1Q62187 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
Ttf1Q62187 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ttf1Q62187 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
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