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Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7
Otol1, Otolin-1, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
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Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Otol1
Q4ZJM7
Gm44358-201
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm8219-201
ENSMUST00000218309
242 nt
BASIC
1.56
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
mt-Tf-201
ENSMUST00000082387
68 nt
BASIC
1.56
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm24030-201
ENSMUST00000083931
164 nt
BASIC
1.56
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm33962-201
ENSMUST00000182643
2592 nt
BASIC
1.56
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Olfr1044-202
ENSMUST00000215171
3266 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Snord64-201
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BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm26011-201
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Rnu7-201
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Mir7039-201
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Mir29c-201
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Olfr1013-202
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APPRIS P1
TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm15115-201
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BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm26091-201
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BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm45886-201
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342 nt
TSL 5
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm23983-201
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BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm22790-201
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129 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm22731-201
ENSMUST00000158086
94 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm23113-201
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99 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm23567-201
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Mir669j-201
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BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm44962-201
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279 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm3333-201
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TSL 5
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm25588-201
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BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Snord118-201
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135 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Mir489-201
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107 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Vmn2r69-201
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2553 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
AC124456.1-201
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BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm19194-201
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BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
AL645643.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm23090-201
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BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm21885-201
ENSMUST00000178891
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BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Mir7225-201
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BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm27668-201
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
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TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm42807-201
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
Gm45027-201
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TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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□□□□□ -2.16
Otol1
Q4ZJM7
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Q4ZJM7
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BASIC
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Otol1
Q4ZJM7
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Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm22761-201
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BASIC
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□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm24171-201
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BASIC
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Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm15068-201
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192 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Scarna3b-201
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BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm27878-201
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BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Mir148b-201
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BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Mir107-201
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BASIC
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□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm25409-201
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BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
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TSL 5
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
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□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Scgb1b23-ps-201
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BASIC
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□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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Otol1
Q4ZJM7
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Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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Otol1
Q4ZJM7
Gm22338-201
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BASIC
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Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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Otol1
Q4ZJM7
Gm26864-201
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BASIC
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Otol1
Q4ZJM7
Gm28669-201
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BASIC
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Otol1
Q4ZJM7
Gm18433-201
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BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
AC147101.2-201
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BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Mir19b-2-201
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BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Olfr1218-202
ENSMUST00000213609
3760 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.17
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Q4ZJM7
Gm26074-201
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BASIC
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□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm25753-201
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121 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm12865-201
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326 nt
TSL 2
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm25623-201
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108 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm22963-201
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91 nt
BASIC
1.5
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Otol1
Q4ZJM7
Gm25994-201
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101 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm25646-201
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BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm9156-201
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463 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm37027-201
ENSMUST00000194642
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TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Snord43-201
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BASIC
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□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Snora2b-201
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BASIC
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□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Snora33-201
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BASIC
1.5
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Otol1
Q4ZJM7
Gm26081-201
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BASIC
1.49
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Otol1
Q4ZJM7
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BASIC
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Q4ZJM7
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BASIC
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Q4ZJM7
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BASIC
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Q4ZJM7
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BASIC
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Q4ZJM7
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Q4ZJM7
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APPRIS P1
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
Gm27265-201
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BASIC
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Otol1
Q4ZJM7
Gm27792-201
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BASIC
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Q4ZJM7
Mir151-201
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BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
G2e3-203
ENSMUST00000121521
2594 nt
APPRIS ALT2
TSL 1 (best)
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Otol1
Q4ZJM7
n-R5s15-201
ENSMUST00000122635
111 nt
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
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