Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VdrP48281 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VdrP48281 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VdrP48281 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VdrP48281 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VdrP48281 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VdrP48281 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VdrP48281 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VdrP48281 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VdrP48281 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VdrP48281 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VdrP48281 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VdrP48281 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VdrP48281 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VdrP48281 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VdrP48281 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VdrP48281 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VdrP48281 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VdrP48281 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VdrP48281 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VdrP48281 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VdrP48281 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VdrP48281 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VdrP48281 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VdrP48281 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
VdrP48281 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VdrP48281 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VdrP48281 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VdrP48281 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VdrP48281 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VdrP48281 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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