Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd11P23813 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Hoxd11P23813 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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