Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccl20O89093 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccl20O89093 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 405.8 ms