Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.3 ms