Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.9 ms