Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Ccdc170D3YXL0 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc170D3YXL0 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc170D3YXL0 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
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