Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoP15409 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoP15409 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoP15409 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoP15409 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoP15409 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoP15409 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoP15409 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoP15409 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoP15409 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoP15409 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoP15409 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms