Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms