Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc47Q9D024 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc47Q9D024 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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