Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
RpainQ9CWY9 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RpainQ9CWY9 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms