Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd11P23813 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.1 ms