Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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Ccdc171E9Q1U1 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc171E9Q1U1 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.6 ms