Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Zbed5B2RPU8 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed5B2RPU8 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms