Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Col5a3Q9JLI2 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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