Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc47Q9D024 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccdc47Q9D024 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc47Q9D024 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.5 ms