Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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RpainQ9CWY9 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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RpainQ9CWY9 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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RpainQ9CWY9 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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RpainQ9CWY9 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RpainQ9CWY9 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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RpainQ9CWY9 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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RpainQ9CWY9 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RpainQ9CWY9 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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