Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ykt6Q9CQW1 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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Ykt6Q9CQW1 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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Ykt6Q9CQW1 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC-0.42□□□□□ -2.48
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Ykt6Q9CQW1 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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Ykt6Q9CQW1 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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Ykt6Q9CQW1 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ykt6Q9CQW1 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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