Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Bco2Q99NF1 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Bco2Q99NF1 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Bco2Q99NF1 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Bco2Q99NF1 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Bco2Q99NF1 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms