Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
Ttf1Q62187 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ttf1Q62187 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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