Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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