Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd10P28359 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Hoxd10P28359 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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