Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Hoxd11P23813 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd11P23813 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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