Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.2 ms