Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Phf11bB4XVQ1 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Phf11bB4XVQ1 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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