Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ssxa1B1AUS7 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ssxa1B1AUS7 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ssxa1B1AUS7 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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