Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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Rnft1Q9DCN7 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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Rnft1Q9DCN7 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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Rnft1Q9DCN7 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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Rnft1Q9DCN7 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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Rnft1Q9DCN7 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rnft1Q9DCN7 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rnft1Q9DCN7 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
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Rnft1Q9DCN7 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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Rnft1Q9DCN7 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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Rnft1Q9DCN7 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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Rnft1Q9DCN7 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rnft1Q9DCN7 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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Rnft1Q9DCN7 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Rnft1Q9DCN7 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rnft1Q9DCN7 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rnft1Q9DCN7 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rnft1Q9DCN7 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rnft1Q9DCN7 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rnft1Q9DCN7 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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