Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Tdrd12Q9CWU0 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Tdrd12Q9CWU0 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Tdrd12Q9CWU0 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms