Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Bco2Q99NF1 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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